Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Rhox8Q6VSS7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rhox8Q6VSS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rhox8Q6VSS7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rhox8Q6VSS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rhox8Q6VSS7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms