Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sort1Q6PHU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sort1Q6PHU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Sort1Q6PHU5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sort1Q6PHU5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 940 ms