Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup98Q6PFD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nup98Q6PFD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup98Q6PFD9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup98Q6PFD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms