Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8M1

Tatdn1, Putative deoxyribonuclease TATDN1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn1Q6P8M1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tatdn1Q6P8M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tatdn1Q6P8M1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tatdn1Q6P8M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tatdn1Q6P8M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms