Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sik3Q6P4S6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sik3Q6P4S6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sik3Q6P4S6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sik3Q6P4S6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Sik3Q6P4S6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms