Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tvp23aQ6NVH0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tvp23aQ6NVH0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tvp23aQ6NVH0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23aQ6NVH0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms