Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
U2surpQ6NV83 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
U2surpQ6NV83 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2surpQ6NV83 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2surpQ6NV83 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms