Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh1Q6IUP1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh1Q6IUP1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sohlh1Q6IUP1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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