Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tpm4Q6IRU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpm4Q6IRU2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpm4Q6IRU2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpm4Q6IRU2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms