Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbf1Q6DFZ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbf1Q6DFZ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbf1Q6DFZ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbf1Q6DFZ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms