Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Nop58Q6DFW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Nop58Q6DFW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nop58Q6DFW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nop58Q6DFW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nop58Q6DFW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nop58Q6DFW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms