Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmcc1Q69ZZ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmcc1Q69ZZ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmcc1Q69ZZ6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms