Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ric1Q69ZJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ric1Q69ZJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ric1Q69ZJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ric1Q69ZJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms