Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab3ipQ68EF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab3ipQ68EF0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab3ipQ68EF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab3ipQ68EF0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms