Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ino80dQ66JY2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80dQ66JY2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ino80dQ66JY2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80dQ66JY2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms