Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprdQ64487 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PtprdQ64487 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtprdQ64487 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprdQ64487 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms