Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly6eQ64253 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly6eQ64253 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ly6eQ64253 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ly6eQ64253 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms