Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PatjQ63ZW7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PatjQ63ZW7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PatjQ63ZW7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PatjQ63ZW7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms