Protein–RNA interactions for Protein: Q63959

Kcnc3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc3Q63959 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Kcnc3Q63959 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20,68■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,9
Kcnc3Q63959 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Kcnc3Q63959 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,7 ms