Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps72Q62481 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps72Q62481 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps72Q62481 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps72Q62481 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms