Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20917Q62457 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20917Q62457 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20917Q62457 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20917Q62457 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms