Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndrg1Q62433 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndrg1Q62433 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms