Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sycp1Q62209 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sycp1Q62209 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sycp1Q62209 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sycp1Q62209 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms