Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnrpaQ62189 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnrpaQ62189 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnrpaQ62189 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnrpaQ62189 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnrpaQ62189 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms