Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema4bQ62179 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema4bQ62179 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema4bQ62179 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema4bQ62179 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms