Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mrc1Q61830 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mrc1Q61830 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mrc1Q61830 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mrc1Q61830 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mrc1Q61830 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms