Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LbpQ61805 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LbpQ61805 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbpQ61805 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LbpQ61805 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LbpQ61805 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LbpQ61805 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LbpQ61805 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LbpQ61805 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LbpQ61805 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.4 ms