Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcf12Q61286 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcf12Q61286 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcf12Q61286 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcf12Q61286 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms