Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf8Q60846 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf8Q60846 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnfrsf8Q60846 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnfrsf8Q60846 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms