Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppp1r1bQ60829 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ppp1r1bQ60829 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppp1r1bQ60829 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppp1r1bQ60829 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms