Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn11Q60771 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn11Q60771 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn11Q60771 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn11Q60771 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms