Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf123Q5XPI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf123Q5XPI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf123Q5XPI3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms