Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp13a4Q5XF90 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp13a4Q5XF90 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a4Q5XF90 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a4Q5XF90 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a4Q5XF90 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms