Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cd200r3Q5UKY4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd200r3Q5UKY4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd200r3Q5UKY4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd200r3Q5UKY4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms