Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpa6Q5U901 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpa6Q5U901 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpa6Q5U901 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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