Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sft2d1Q5SSN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sft2d1Q5SSN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms