Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps41Q5KU39 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps41Q5KU39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps41Q5KU39 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms