Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp13Q5BKP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp13Q5BKP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp13Q5BKP2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp13Q5BKP2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms