Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrfip1Q3UZ39 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrfip1Q3UZ39 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrfip1Q3UZ39 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms