Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pfdn4Q3UWL8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn4Q3UWL8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn4Q3UWL8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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