Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slfn4Q3UV66 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slfn4Q3UV66 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slfn4Q3UV66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn4Q3UV66 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms