Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q3U6N9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3U6N9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U6N9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3U6N9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3U6N9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U6N9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3U6N9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U6N9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U6N9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3U6N9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U6N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U6N9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U6N9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U6N9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3U6N9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U6N9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U6N9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3U6N9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3U6N9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U6N9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3U6N9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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