Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3U595 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U595 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U595 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3U595 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U595 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U595 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3U595 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U595 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3U595 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U595 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U595 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U595 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3U595 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3U595 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U595 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U595 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U595 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3U595 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3U595 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q3U595 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U595 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U595 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U595 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U595 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U595 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3U595 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3U595 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U595 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3U595 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3U595 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U595 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U595 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U595 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3U595 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3U595 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3U595 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3U595 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q3U595 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U595 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U595 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U595 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U595 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U595 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q3U595 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q3U595 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms