Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pag1Q3U1F9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pag1Q3U1F9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pag1Q3U1F9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pag1Q3U1F9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms