Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrc28Q3TX51 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc28Q3TX51 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc28Q3TX51 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrc28Q3TX51 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrc28Q3TX51 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrc28Q3TX51 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc28Q3TX51 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms