Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eepd1Q3TGW2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Eepd1Q3TGW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eepd1Q3TGW2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Eepd1Q3TGW2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms