Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZufspQ3T9Z9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZufspQ3T9Z9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZufspQ3T9Z9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZufspQ3T9Z9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms