Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccbe1Q3MI99 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccbe1Q3MI99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccbe1Q3MI99 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms