Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNI6

Pih1d3, Protein PIH1D3, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pih1d3Q3KNI6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pih1d3Q3KNI6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pih1d3Q3KNI6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pih1d3Q3KNI6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pih1d3Q3KNI6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pih1d3Q3KNI6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pih1d3Q3KNI6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pih1d3Q3KNI6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms