Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pi4k2aQ2TBE6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pi4k2aQ2TBE6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pi4k2aQ2TBE6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pi4k2aQ2TBE6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms